GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1201 - 1225 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Defective SLC1A3 causes episodic ataxia 6 (EA6)
  • EAAT1
  • GLAST
  • GLAST1
  • SLC1A3
Homo sapiens (human)
Intra-Golgi traffic
  • ALPP
  • ARF1
  • ARNO
  • ARNO3
  • BET1L
  • CEV14
  • CIP150
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • CUTL1
  • CUX1
  • CYT4
  • CYTH1
  • CYTH2
  • CYTH3
  • CYTH4
  • D17S811E
  • GIMPC
  • GOLGA5
  • GOLIM4
  • GOLPH4
  • GOLTC1
  • GOSR1
  • GOSR2
  • GPP130
  • GRP1
  • GS15
  • GS27
  • GS28
  • GTC90
  • KIAA0258
  • KIAA1134
  • KIAA1381
  • KIAA1432
  • LDLB
  • LDLC
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1A3
  • MAN1B
  • MAN1C
  • MAN1C1
  • MAN2A1
  • MAN2A2
  • MANA2
  • MANA2X
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NSF
  • PLAP
  • PSCD1
  • PSCD2
  • PSCD2L
  • PSCD3
  • PSCD4
  • RAB30
  • RAB33B
  • RAB36
  • RAB39
  • RAB39A
  • RAB41
  • RETII
  • RFG5
  • RGP1
  • RIC1
  • SEC34
  • SNAP29
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • STX16
  • STX5
  • STX5A
  • STX6
  • TRIP11
  • VPS45
  • VPS45A
  • VPS45B
  • VTI1A
  • YKT6
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of aspirin-triggered D-series resolvins
  • ALOX5
  • LOG5
  • LTA4
  • LTA4H
Homo sapiens (human)
Intrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • A2M
  • AT3
  • BDK
  • C1IN
  • C1NH
  • C1QBP
  • CPAMD5
  • F10
  • F11
  • F12
  • F2
  • F8
  • F8C
  • F8VWF
  • F9
  • GC1QBP
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • HABP1
  • HCF2
  • KLK3
  • KLKB1
  • KNG
  • KNG1
  • PCI
  • PCP
  • PI7
  • PLANH3
  • PN1
  • PRCP
  • PROC
  • PROCI
  • PROS
  • PROS1
  • SERPINA5
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • SERPING1
  • SF2P32
  • VWF
Homo sapiens (human)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • CRKL
  • GAB1
  • GGA3
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA0154
  • MET
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB4B
Homo sapiens (human)
IRS-mediated signalling
  • GRB1
  • IRS1
  • IRS2
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression to control bile acid homeostasis
  • BHLHE74
  • CTG26
  • FABP6
  • GNT1
  • ILBP
  • ILLBP
  • KIAA1047
  • LXRA
  • LXRB
  • NCOA1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • RXRA
  • RXRB
  • SRC1
  • UGT1
  • UGT1A3
  • UNR
Homo sapiens (human)
FLT3 signaling through SRC family kinases
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • HCK
  • LCK
  • STK1
  • SYK
Homo sapiens (human)
Maturation of protein E
  • E
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • sM
Homo sapiens (human)
Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency
  • ASNS
  • ATF3
  • ATF4
  • ATF5
  • ATFX
  • BOTCH
  • C20orf97
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHAC1
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • DDIT3
  • EIF2A
  • EIF2AK1
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • GADD153
  • GADD34
  • GRB10
  • GRBIR
  • HRI
  • KIAA0207
  • KIAA1369
  • NIPK
  • PPP1R15A
  • SKIP3
  • TCF5
  • TRB3
  • TRIB3
  • TS11
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Establishment of Sister Chromatid Cohesion
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CDCA5
  • CSPG6
  • DXS423E
  • EFO1
  • ESCO1
  • ESCO2
  • FOE
  • HR21
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0979
  • KIAA1911
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC3
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
Tat-mediated HIV elongation arrest and recovery
  • C19orf17
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK9
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
  • tat
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by REV1
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLZ
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL17RD
  • IL17RLM
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K1
  • MAP2K1IP1
  • MAP2K2
  • MAPBPIP
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKSP1
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MORG1
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • ROBLD3
  • SEF
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
PI5P Regulates TP53 Acetylation
  • C14orf9
  • EP300
  • ING1L
  • ING2
  • MAP2K6
  • MEK6
  • MKK6
  • P300
  • P53
  • PI5P4KA
  • PIN1
  • PIP4K2A
  • PIP4K2B
  • PIP4K2C
  • PIP4P1
  • PIP5K2
  • PIP5K2A
  • PIP5K2B
  • PIP5K2C
  • PRKMK6
  • SKK3
  • TMEM55B
  • TP53
Homo sapiens (human)
Clearance of dopamine
  • DAT1
  • MAOA
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Processive synthesis on the C-strand of the telomere
  • ACD
  • BLM
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • WRN
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR1 in disease
  • BAG4
  • BCR
  • BCR1
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CD245
  • CEK
  • CEP43
  • CFIM68
  • CPSF6
  • CUTL1
  • CUX1
  • D22S11
  • ERLIN2
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FGFR1OP
  • FGFR1OP2
  • FIM
  • FLG
  • FLT2
  • FOP
  • FRS2
  • GAB1
  • GCF2
  • GRB1
  • HBGFR
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KIAA0216
  • KS3
  • LRRFIP1
  • MYO18A
  • MYSPDZ
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • RAMP
  • RNF82
  • SODD
  • SOS1
  • SPFH2
  • TIAF1
  • TIF1
  • TIF1A
  • TRIM24
  • TRIP
  • ZMYM2
  • ZNF198
Homo sapiens (human)
Terminal pathway of complement
  • APOJ
  • C5
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CLI
  • CLU
  • CPAMD4
  • KUB1
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA transmembrane, juxtamembrane and kinase domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)
HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA
  • ANP32A
  • APRIL
  • C15orf1
  • CAIN
  • CAN
  • CRM1
  • ELAVL1
  • HUR
  • KIAA0023
  • LANP
  • MAPM
  • NUP214
  • PHAP1
  • PKCA
  • PKCD
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • SET
  • TALL2
  • TNFSF13
  • XPO1
  • ZTNF2
Homo sapiens (human)
PTEN Loss of Function in Cancer
  • MMAC1
  • PTEN
  • TEP1
Homo sapiens (human)
TGFBR2 MSI Frameshift Mutants in Cancer
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint
  • ADRM1
  • C7orf76
  • CAP20
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • DIR1
  • DSS1
  • FKBPL
  • GP110
  • GTSE1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0107
  • LMPX
  • LMPY
  • MAPRE1
  • MB1
  • MDA6
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NG7
  • NU
  • P34CDC2
  • P53
  • PFAAP4
  • PIC1
  • PLK
  • PLK1
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SDI1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WAF1
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
PDE3B signalling
  • AKT2
  • PDE3B
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: December 9, 2024