GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 301 - 325 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
RNA Polymerase I Promoter Escape
  • ASE1
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CAST
  • CBX3
  • CCNH
  • CD3EAP
  • CDK7
  • CDKN7
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2D1
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • JOSD3
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • PAF49
  • PAF53
  • POLR1A
  • POLR1B
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR1F
  • POLR1G
  • POLR1H
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PRAF1
  • RNF66
  • RPA12
  • RRN3
  • STK1
  • TAF1A
  • TAF1B
  • TAF1C
  • TAF1D
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TIFIA
  • TSH2B
  • TTDA
  • TWISTNB
  • UBF
  • UBF1
  • UBTF
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • ZNRD1
Homo sapiens (human)
Defective Intrinsic Pathway for Apoptosis Due to p14ARF Loss of Function
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
CRMPs in Sema3A signaling
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN5
  • CRMP1
  • CRMP2
  • CRMP3
  • CRMP4
  • CRMP5
  • DPYSL1
  • DPYSL2
  • DPYSL3
  • DPYSL4
  • DPYSL5
  • DRP3
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • GSK3B
  • KIAA0463
  • KIAA1550
  • NCK5A
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • PSSALRE
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • ULIP
  • ULIP1
  • ULIP2
  • ULIP3
  • ULIP4
  • ULIP6
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Regulation of Complement cascade
  • ACBP
  • APOJ
  • AZ3B
  • BF
  • BFD
  • C1IN
  • C1NH
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C3BR
  • C3DR
  • C3R1
  • C4A
  • C4B
  • C4BP
  • C4BPA
  • C4BPB
  • C4B_2
  • C5
  • C5AR
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C5R1
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD19
  • CD46
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHL
  • CFHL1
  • CFHL1P
  • CFHL2
  • CFHL3
  • CFHL4
  • CFHL5
  • CFHR1
  • CFHR1P
  • CFHR2
  • CFHR3
  • CFHR4
  • CFHR5
  • CFI
  • CLI
  • CLU
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • CR
  • CR1
  • CR2
  • DAF
  • ELA2
  • ELANE
  • F2
  • FHR1
  • FHR2
  • FHR3
  • FHR4
  • FHR5
  • GPR77
  • HF
  • HF1
  • HF2
  • HFL1
  • HFL2
  • HFL3
  • HNFAG09
  • IF
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • KUB1
  • MCP
  • MIC10
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • PROS
  • PROS1
  • SERPING1
  • TAPA1
  • TSPAN28
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • VTN
Homo sapiens (human)
Polymerase switching on the C-strand of the telomere
  • ACD
  • C16orf41
  • C17orf106
  • C17orf68
  • CHTF18
  • CHTF8
  • CTC1
  • CTF18
  • CTF8
  • DCC1
  • DRIP5
  • DSCC1
  • KIAA0039
  • OBFC1
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
  • PTOP
  • RAP1
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • STN1
  • TEN1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • ADAM2
  • ADAM20
  • ADAM21
  • ADAM30
  • B4GALT1
  • FTNB
  • GGTB2
  • HYAL3
  • MUC9
  • OGP
  • OVGP1
  • PH20
  • SPAM1
  • ZP1
  • ZP2
  • ZP3
  • ZP3A
  • ZP3B
  • ZP4
  • ZPA
  • ZPB
  • ZPC
Homo sapiens (human)
FCGR3A-mediated IL10 synthesis
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • AHCYL1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CD16A
  • CD32
  • CD3G
  • DCAL
  • FCG1
  • FCG2
  • FCG3
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR2A
  • FCGR2A1
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FGR
  • FYN
  • HCK
  • IGFR1
  • IGFR2
  • IGFR3
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • IL10
  • INSP3R1
  • IRBIT
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • JTK8
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • LPG1G
  • LPG1G2
  • LYN
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PKX1
  • PLC1
  • PLCG1
  • PLCG2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKX
  • SRC2
  • SYK
  • T3G
  • TSE1
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • XPVKONA
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Inhibition of membrane repair
  • HGS
  • HRS
  • cfp7
  • esxG
  • esxH
Homo sapiens (human)
LGI-ADAM interactions
  • ADAM11
  • ADAM22
  • ADAM23
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG8
  • DLG4
  • EPT
  • KIAA1916
  • LGI1
  • LGI2
  • LGI3
  • LGI4
  • LGIL2
  • LGIL3
  • LGIL4
  • MDC
  • MDC2
  • MDC3
  • PSD95
  • STX1
  • STX1A
  • STX1B
  • STX1B1
  • STX1B2
Homo sapiens (human)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • CTNS
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLT1
  • HEAAC1
  • SAMC
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC25A26
  • SLC32A1
  • VGAT
  • VIAAT
Homo sapiens (human)
CLEC7A/inflammasome pathway
  • ASC
  • CARD5
  • CASP8
  • IL1B
  • IL1F2
  • MALT1
  • MCH5
  • MLT
  • NFKB1
  • NFKB3
  • PYCARD
  • RELA
  • TMS1
Homo sapiens (human)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport
  • C15orf6
  • CDRC2
  • PDRC2
  • RH50
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
  • RHGK
Homo sapiens (human)
Signaling by LTK in cancer
  • CLIP1
  • CYLN1
  • ERK1
  • ERK2
  • GRB1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RSN
Homo sapiens (human)
Relaxin receptors
  • GPCR135
  • GPCR142
  • GPR100
  • GPR106
  • GREAT
  • INSL3
  • INSL5
  • INSL7
  • LGR7
  • LGR8
  • RLF
  • RLN2
  • RLN3
  • RLN3R1
  • RLN3R2
  • RLNL
  • RXFP1
  • RXFP2
  • RXFP3
  • RXFP4
  • RXN3
  • SALPR
  • ZINS4
Homo sapiens (human)
Caspase-mediated cleavage of cytoskeletal proteins
  • ADD1
  • ADDA
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CMAP
  • CPP32
  • DBNL
  • GAS2
  • GSN
  • MAPT
  • MAPTL
  • MCH2
  • MCH3
  • MCH5
  • MTBT1
  • NEAS
  • PLEC
  • PLEC1
  • SH3P7
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • TAU
  • VIM
Homo sapiens (human)
HDL assembly
  • A2M
  • ABC1
  • ABCA1
  • APOA1
  • CERP
  • CPAMD5
  • KIAA1292
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • ZDHHC8
  • ZDHHCL1
  • ZNF378
Homo sapiens (human)
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation
  • AKT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DHFR
  • DYT5
  • GCH
  • GCH1
  • GCHFR
  • GFRP
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NOS3
  • PKB
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • PTS
  • RAC
  • SPR
Homo sapiens (human)
Cellular response to hypoxia
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • EPAS1
  • FIH1
  • HIF1A
  • HIF1AN
  • HIF2A
  • MOP1
  • MOP2
  • PASD2
  • PASD8
Homo sapiens (human)
Transport of RCbl within the body
  • 8D6A
  • ABCC1
  • ABCD4
  • ARH
  • C6orf209
  • CD320
  • LDLRAP1
  • LMBRD1
  • LRP2
  • MRP
  • MRP1
  • NESI
  • PXMP1L
  • TC1
  • TC2
  • TCN1
  • TCN2
Homo sapiens (human)
Sensing of DNA Double Strand Breaks
  • ATM
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KPNA2
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • RAD50
  • RCH1
  • SRP1
  • TIP60
Homo sapiens (human)
Metabolism of ingested SeMet, Sec, MeSec into H2Se
  • AHCY
  • AMS1
  • CBS
  • CTH
  • GNMT
  • HNMT
  • MAT1A
  • MATA1
  • NNMT
  • SAHH
  • SCL
  • SCLY
Homo sapiens (human)
FOXO-mediated transcription of cell death genes
  • AFX
  • AFX1
  • APT1LG1
  • BBC3
  • BCL2L11
  • BCL5
  • BCL6
  • BIM
  • CBP
  • CD95L
  • CHOP
  • CHOP10
  • CITED2
  • CREBBP
  • DDIT3
  • EP300
  • FASL
  • FASLG
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FOXO4
  • GADD153
  • HAP3
  • LAZ3
  • LKB1
  • MLLT7
  • MRG1
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • P300
  • PINK1
  • PJS
  • PUMA
  • STK11
  • TNFSF6
  • ZBTB27
  • ZNF51
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodeling of DAG and TAG
  • ADPN
  • AGRP1
  • ATGL
  • AWAT2
  • C22orf20
  • DC3
  • DC4
  • DGAT
  • DGAT1
  • DGAT2
  • DGAT2L4
  • DGAT2L6
  • MFAT
  • MGLL
  • PNPLA2
  • PNPLA3
  • WS
Homo sapiens (human)
Formation of intermediate mesoderm
  • BMP2B
  • BMP4
  • DVR4
  • FGF2
  • FGFB
  • FKHL14
  • FKHL7
  • FOXC1
  • FOXC2
  • FREAC3
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • MFH1
  • ODD
  • OSR1
  • PAX2
  • PAX8
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP Dependant Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • HBP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SLBP
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)

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Last updated: December 9, 2024