GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1676 - 1700 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Activation of the TFAP2 (AP-2) family of transcription factors
  • AP2TF
  • CBP
  • CITED1
  • CITED2
  • CITED4
  • CREBBP
  • EP300
  • FOR
  • GAS41
  • MRG1
  • MRG2
  • MSG1
  • P300
  • SDR41C1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2B
  • TFAP2BL1
  • TFAP2C
  • TFAP2D
  • TFAP2E
  • WOX1
  • WWOX
  • YEATS4
Homo sapiens (human)
POLB-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • ADPRHL2
  • ADPRS
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • ARH3
  • FEN1
  • HAP1
  • LIG1
  • PARG
  • PARP1
  • PARP2
  • POLB
  • PPOL
  • RAD2
  • REF1
Homo sapiens (human)
Citric acid cycle (TCA cycle)
  • ACO2
  • CS
  • CYB560
  • FH
  • HSP75
  • HSPC5
  • IDH2
  • IDH3A
  • IDH3B
  • IDH3G
  • MDH2
  • NNT
  • SDH
  • SDH1
  • SDH2
  • SDH3
  • SDH4
  • SDHA
  • SDHB
  • SDHC
  • SDHD
  • SDHF
  • SUCLA2
  • SUCLG1
  • SUCLG2
  • TRAP1
Homo sapiens (human)
Regulation of expression of SLITs and ROBOs
  • ADRM1
  • BBC1
  • C7orf76
  • CASC3
  • CBP20
  • CBP80
  • CCG2
  • CLIM2
  • COL4A5
  • CUL2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DAG1
  • DDX48
  • DSS1
  • DUTT1
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF4A3
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • ELOB
  • ELOC
  • ERF1
  • ERF3A
  • ERF3B
  • ETF1
  • FAU
  • FTE1
  • GP110
  • GSPT1
  • GSPT2
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HOX1K
  • HOXA2
  • HSPC
  • ISL1
  • KIAA0107
  • KIAA0111
  • KIAA0813
  • KIAA0913
  • KIAA1097
  • KIAA1408
  • KIAA1568
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LDB1
  • LDC2
  • LH2
  • LHX2
  • LHX3
  • LHX4
  • LHX9
  • LMPX
  • LMPY
  • MAGOH
  • MAGOH2
  • MAGOHA
  • MAGOHB
  • MB1
  • MEGF4
  • MFTL
  • MIP224
  • MLN51
  • MOV34L
  • MPS1
  • MSI1
  • MSS1
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEDD6
  • NU
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • QM
  • RBM8
  • RBM8A
  • RBX1
  • RENT2
  • RENT3A
  • RENT3B
  • RF1
  • RIG
  • RNF75
  • RNPS1
  • ROBO1
  • ROBO2
  • ROC1
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SLIL1
  • SLIL3
  • SLIT1
  • SLIT2
  • SUG1
  • SUG2
  • SUP45L1
  • SURF-3
  • SURF3
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UPF2
  • UPF3
  • UPF3A
  • UPF3B
  • UPF3X
  • USP33
  • VDU1
  • X
  • Y
  • Z
  • ZSWIM8
Homo sapiens (human)
Transfer of LPS from LBP carrier to CD14
  • CD14
  • LBP
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • API4
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BIRC5
  • BTAK
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CDCA8
  • CG1
  • D3S1231E
  • IAK1
  • IAP4
  • INCENP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNA
  • PCNT1
  • PESCRG3
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • STK1
  • STK12
  • STK15
  • STK5
  • STK6
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TMEM48
  • TOP1
  • TOP2
  • TOP2A
  • TOP2B
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Prednisone ADME
  • ABCB1
  • AKR1C1
  • ALB
  • CBG
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • DDH
  • DDH1
  • GNT1
  • HSD11
  • HSD11B1
  • HSD11B2
  • HSD11K
  • HSD11L
  • MDR1
  • PGY1
  • SDR26C1
  • SDR9C3
  • SERPINA6
  • UGT1
  • UGT1A3
  • UGT2B17
  • UGT2B7
  • UGTB2B9
Homo sapiens (human)
Attachment and Entry
  • 3a
  • 7a
  • ACE2
  • AGRIN
  • AGRN
  • CTSL
  • CTSL1
  • E
  • FUR
  • FURIN
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HAVCR1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • KIM1
  • M
  • N
  • NRP
  • NRP1
  • OCI5
  • PACE
  • PCSK3
  • PRSS10
  • S
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • TIM1
  • TIMD1
  • TMPRSS2
  • VCP
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Synthesis And Processing Of GAG, GAGPOL Polyproteins
  • gag
Homo sapiens (human)
Sema4D induced cell migration and growth-cone collapse
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • C9orf164
  • CD100
  • ERBB2
  • HER2
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0407
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LARG
  • LIMK
  • LIMK1
  • LIMK2
  • MLC2
  • MLN19
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYRL2
  • NEU
  • NGL
  • PLXN5
  • PLXNB1
  • RHO12
  • RHO6
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • RND1
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SEMA4D
  • SEMAJ
  • SEP
Homo sapiens (human)
SHC1 events in EGFR signaling
  • AREG
  • AREGB
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • EREG
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • SDGF
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
  • TGFA
Homo sapiens (human)
O-linked glycosylation of mucins
  • A4GNT
  • B3GALT7
  • B3GALT8
  • B3GNT1
  • B3GNT2
  • B3GNT3
  • B3GNT4
  • B3GNT5
  • B3GNT6
  • B3GNT7
  • B3GNT8
  • B3GNT9
  • B3GNTL1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • BGALT15
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • C20orf105
  • C6orf205
  • CA125
  • CHST4
  • COSMC
  • DRCC1
  • GALNT1
  • GALNT10
  • GALNT11
  • GALNT12
  • GALNT13
  • GALNT14
  • GALNT15
  • GALNT16
  • GALNT17
  • GALNT18
  • GALNT2
  • GALNT3
  • GALNT4
  • GALNT5
  • GALNT6
  • GALNT7
  • GALNT8
  • GALNT9
  • GALNTL1
  • GALNTL2
  • GALNTL4
  • GALNTL5
  • GALNTL6
  • GCNT1
  • GCNT3
  • GCNT4
  • GCNT7
  • KIAA1130
  • KIAA1359
  • KIAA1918
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • NACGT2
  • PUM
  • QTGAL
  • RECC
  • SBEM
  • SMUC
  • TMEM3
  • WBSCR17
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 binding to SEM1 (DSS1)
  • BRCA2
  • C7orf76
  • DSS1
  • FACD
  • FANCD1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
Homo sapiens (human)
Classical antibody-mediated complement activation
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • CRP
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • PTX1
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
Homo sapiens (human)
Signal transduction by L1
  • CAML1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERK1
  • ERK2
  • FNRA
  • FNRB
  • G5A
  • GP2B
  • GP3A
  • HER1
  • ITGA2B
  • ITGA5
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • L1CAM
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDF2
  • MEK1
  • MEK2
  • MIC5
  • MKK2
  • MSK12
  • MSK8
  • NCAM
  • NCAM1
  • NRP
  • NRP1
  • PAK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAC1
  • TC25
  • VAV2
  • VEGF165R
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Transport of fatty acids
  • ACSVL2
  • ACSVL4
  • ACSVL5
  • APOD
  • FACVL2
  • FATP1
  • FATP4
  • FATP6
  • LCN1
  • LCN12
  • LCN15
  • LCN9
  • SLC27A1
  • SLC27A4
  • SLC27A6
  • VEGP
Homo sapiens (human)
Anchoring fibril formation
  • BMP1
  • COL7A1
  • KIAA0932
  • LAMA3
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC2
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • PCOLC
  • TLL
  • TLL1
  • TLL2
Homo sapiens (human)
Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • C2orf31
  • CAV
  • CAV1
  • CK1G2
  • CSNK1A1
  • CSNK1G2
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FAM123B
  • FRAT1
  • FRAT2
  • FZD1
  • FZD2
  • FZD5
  • GSK3B
  • INT1
  • KIAA0044
  • KIAA0208
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WNT1
  • WNT3A
  • WNT8A
  • WNT8B
  • WNT8D
  • WTX
Homo sapiens (human)
HS-GAG biosynthesis
  • 3OST
  • 3OST1
  • 3OST2
  • 3OST3A1
  • 3OST3B1
  • 3OST4
  • 3OST5
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GLCE
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HFRC
  • HS2ST
  • HS2ST1
  • HS3OST5
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSST
  • HSST1
  • HSST2
  • HSST3
  • HSST4
  • KIAA0448
  • KIAA0468
  • KIAA0836
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
  • UGTREL8
Homo sapiens (human)
Formation of lateral plate mesoderm
  • BMP2B
  • BMP4
  • DVR4
  • FKHL5
  • FOXF1
  • FREAC1
  • GATA4
  • IHH
  • SHH
Homo sapiens (human)
Paradoxical activation of RAF signaling by kinase inactive BRAF
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • BRAP
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KRAS
  • KRAS2
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MLK3
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PHB
  • PHB1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PTK1
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RASK2
  • RIAM
  • RNF52
  • SPRK
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
TFAP2 (AP-2) family regulates transcription of cell cycle factors
  • AP2TF
  • BHLHE39
  • CAP20
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • JARID1B
  • KDM5B
  • MDA6
  • MYC
  • PIC1
  • PLU1
  • RBBP2H1
  • SDI1
  • TFAP2
  • TFAP2A
  • TFAP2C
  • WAF1
Homo sapiens (human)
Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA
  • ABS
  • C20orf183
  • DDX41
  • DLM1
  • DTX4
  • ERIS
  • HT2A
  • IRF3
  • KIAA0937
  • MITA
  • NAK
  • NALP4
  • NLRP4
  • PAN2
  • PYPAF4
  • RNF109
  • RNF155
  • RNF81
  • RNH2
  • RO52
  • RPS27A
  • SSA1
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
  • TRIM21
  • TRIM32
  • TRIM56
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • CALP
  • CSEN
  • DREAM
  • KCHIP1
  • KCHIP2
  • KCHIP3
  • KCHIP4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
  • KIAA1044
  • VABP
Homo sapiens (human)
FLT3 mutants bind TKIs
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

Click here to visit the beta site.


International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024