GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1926 - 1950 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
GRB7 events in ERBB2 signaling
  • ERBB2
  • GGF
  • GRB7
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NTAK
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells
  • AD4BP
  • APRF
  • BHLHE17
  • BHLHE73
  • CSDD1
  • DPC4
  • EPAS1
  • EZF
  • FTZF1
  • GKLF
  • HIF2A
  • HIF3A
  • KLF4
  • LIN28
  • LIN28A
  • MADH2
  • MADH4
  • MADR2
  • MOP2
  • MOP7
  • NANOG
  • NR5A1
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • PASD2
  • PASD7
  • PBX1
  • POU5F1
  • PRDM14
  • PRL
  • SALL4
  • SF1
  • SMAD2
  • SMAD4
  • SOX2
  • STAT3
  • ZCCHC1
  • ZIC3
  • ZNF203
  • ZNF206
  • ZNF797
  • ZSCAN10
Homo sapiens (human)
ESR-mediated signaling
  • AIG6
  • CYP40
  • CYPD
  • ERK1
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FKBP4
  • FKBP5
  • FKBP51
  • FKBP52
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NR3A1
  • NR3A2
  • P23
  • PPID
  • PPP5
  • PPP5C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTGES3
  • TEBP
Homo sapiens (human)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • AKT3
  • ALX3
  • BHLHB24
  • BHLHE32
  • BHLHE33
  • BHLHE34
  • BHLHE35
  • BRN2
  • CBP
  • CDH1
  • CDHE
  • CREBBP
  • CRM1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DARS
  • DARS1
  • EDN1
  • EDN3
  • EDNRB
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • ERK1
  • ERK2
  • ETRB
  • FOXD3
  • GLNS
  • GSK3B
  • HDAC1
  • HFH2
  • HINT
  • HINT1
  • HUP2
  • IARS
  • IARS1
  • ID
  • ID1
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • KIT
  • LARS
  • LARS1
  • LEF1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKAPK1A
  • MARS
  • MARS1
  • MC1R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MITF
  • MSHR
  • OCT7
  • OTF7
  • P18
  • PARS
  • PAX3
  • PKBG
  • PKCI1
  • POMC
  • POU3F2
  • PRKCNH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • RPD3L1
  • RPS6KA1
  • RSK1
  • SCFR
  • SCYE1
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SLUG
  • SLUGH
  • SNAI2
  • SOX10
  • SOX2
  • SOX9
  • TBX3
  • TCFEC
  • TFE3
  • TFEB
  • TFEC
  • TFECL
  • UVO
  • WNT3A
  • XPO1
  • ZIC
  • ZIC1
  • ZNF201
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA methylation proteins
  • AIM
  • BAP1
  • BMI1
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CXXC9
  • DING
  • DNMT
  • DNMT1
  • DNMT3A
  • DNMT3B
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • HIPI3
  • MEL18
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZNF144
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in Cytochrome C Release
  • 15E1.1
  • AIFM2
  • AMID
  • ASPP1
  • ASPP2
  • ATM
  • BAX
  • BBC3
  • BBP
  • BCL2L4
  • BID
  • BNIP3A
  • BNIP3H
  • BNIP3L
  • C18orf43
  • CBP
  • CREBBP
  • KET
  • KIAA0771
  • NIX
  • NOXA
  • P53
  • P53DINP1
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PMAIP1
  • PPP1R13B
  • PRELI
  • PRELID1
  • PRELID3A
  • PRG3
  • PUMA
  • SIP
  • SLMO1
  • STEAP3
  • TP53
  • TP53AIP1
  • TP53BP2
  • TP53INP1
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRIAP1
  • TSAP6
  • ZNF420
Homo sapiens (human)
Glutathione synthesis and recycling
  • BOTCH
  • C7orf24
  • CHAC1
  • CHAC2
  • CN2
  • CNDP2
  • CPGL
  • CRF21
  • GCLC
  • GCLM
  • GGCT
  • GGT
  • GGT1
  • GGT3
  • GGT3P
  • GGT5
  • GGT6
  • GGT7
  • GGTL3
  • GGTL5
  • GGTLA1
  • GLCL
  • GLCLC
  • GLCLR
  • GSS
  • HEL-S-13
  • OPLAH
  • PEPA
Homo sapiens (human)
KW2449-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Signaling by BRAF and RAF1 fusions
  • ADTB3A
  • AGGF1
  • AGK
  • AGTRAP
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • AP3B1
  • APBB1IP
  • APG7L
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • ATG7
  • ATPSK1
  • ATRAP
  • BCL2L11
  • BIM
  • BRAF
  • BRAF1
  • C5orf3
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CLCN6
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • ESRP1
  • F8VWF
  • FAM114A2
  • FAM131B
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • FXR1
  • GP2B
  • GP3A
  • GPATC7
  • GPATCH7
  • HKQ
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • JAK2
  • JHDM1D
  • KDM7
  • KDM7A
  • KIAA0046
  • KIAA0051
  • KIAA0773
  • KIAA0803
  • KIAA0864
  • KIAA0902
  • KIAA0968
  • KIAA1027
  • KIAA1042
  • KIAA1549
  • KIAA1718
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • LMN1
  • LMNA
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MPRIP
  • MRIP
  • MULK
  • NRAS
  • OIP106
  • PAPD7
  • PAPSS
  • PAPSS1
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • POLS
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • QKI
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RBM35A
  • RHOIP3
  • RIAM
  • RNF82
  • SND1
  • SRC
  • SRC1
  • TDRD11
  • TENT4A
  • TIF1
  • TIF1A
  • TLN
  • TLN1
  • TRAK1
  • TRF4
  • TRIM24
  • VCL
  • VG5Q
  • VWF
  • YWHAB
  • ZC3HAV1
  • ZC3HDC2
Homo sapiens (human)
Activation of PKB
  • AKT2
  • C20orf97
  • CTMP
  • NIPK
  • PDK1
  • PDPK1
  • SKIP3
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through CDC42
  • ARHGEF6
  • CDC42
  • COOL2
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • KIAA0006
  • PAK1
  • PIXA
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of myeloid cells
  • AML1
  • CBFA2
  • CBFB
  • CBP
  • CREBBP
  • CSF2
  • GMCSF
  • LGALS3
  • MAC2
  • PKCB
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • RUNX1
Homo sapiens (human)
Activated point mutants of FGFR2
  • BEK
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KGFR
  • KS3
  • KSAM
Homo sapiens (human)
HDL clearance
  • AMN
  • APOA1
  • CUBN
  • HBP
  • HDLBP
  • IFCR
  • VGL
Homo sapiens (human)
SUMOylation of intracellular receptors
  • AD4BP
  • AR
  • DDXBP1
  • DHTR
  • ERBA2
  • ESR
  • ESR1
  • FTZF1
  • GRL
  • HDAC4
  • KIAA0288
  • LXRB
  • MCR
  • MLR
  • NER
  • NOT
  • NR1A2
  • NR1B1
  • NR1C1
  • NR1C3
  • NR1F1
  • NR1H2
  • NR1I1
  • NR2B1
  • NR2C1
  • NR3A1
  • NR3C1
  • NR3C2
  • NR3C3
  • NR3C4
  • NR4A2
  • NR5A1
  • NURR1
  • PGR
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARG
  • RARA
  • RORA
  • RXRA
  • RZRA
  • SF1
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • THR1
  • THRB
  • TINUR
  • TR2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • UNR
  • VDR
Homo sapiens (human)
Common Pathway of Fibrin Clot Formation
  • AT3
  • CD177
  • CF2R
  • CXCL4
  • CXCL4V1
  • EPCR
  • F10
  • F13A
  • F13A1
  • F13B
  • F2
  • F2R
  • F5
  • F8
  • F8C
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • HCF2
  • MBN
  • NB1
  • PAR1
  • PCI
  • PF4
  • PF4V1
  • PI7
  • PLANH3
  • PN1
  • PROC
  • PROCI
  • PROCR
  • PROS
  • PROS1
  • PRTN3
  • PRV1
  • SCYB4
  • SCYB4V1
  • SERPINA5
  • SERPINC1
  • SERPIND1
  • SERPINE2
  • THBD
  • THRM
  • TR
Homo sapiens (human)
cell division
  • KIF20A
  • KIF23
  • KNSL5
  • MKLP1
  • MKLP2
  • PLK
  • PLK1
  • RAB6KIFL
Homo sapiens (human)
Adenylate cyclase inhibitory pathway
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAL
  • GNAT3
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
Homo sapiens (human)
Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling
  • AKT1
  • ALOX15
  • ALOX5
  • ANX1
  • ANXA1
  • API4
  • APRF
  • APT1LG1
  • AREB6
  • ARHU
  • BATF
  • BCL1
  • BCL2
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCL2L3
  • BCL5
  • BCL6
  • BCLX
  • BHLHA38
  • BHLHE39
  • BHLHE78
  • BIRC5
  • CAP20
  • CCL11
  • CCL2
  • CCL22
  • CCND1
  • CD11B
  • CD11C
  • CD18
  • CD23A
  • CD36
  • CD95L
  • CDC42L1
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CEBPD
  • CHEDG1
  • CIP1
  • CIS3
  • CIS6
  • CISH5
  • CISH6
  • CLEC4J
  • CLG
  • CLG4A
  • CLG4B
  • CLGI
  • COL1A2
  • COX2
  • CR3A
  • CTLA8
  • CXCL8
  • EDG1
  • F13A
  • F13A1
  • FAN1
  • FASL
  • FASLG
  • FCE2
  • FCER2
  • FGF2
  • FGFB
  • FKHR
  • FKHRL1
  • FN
  • FN1
  • FNRB
  • FOS
  • FOXO1
  • FOXO1A
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FSCN1
  • G0S7
  • G28K
  • GATA3
  • GP3B
  • GP4
  • GRB1
  • GRP94
  • HGF
  • HIF1A
  • HILDA
  • HMOX1
  • HNL
  • HO
  • HO1
  • HPTA
  • HSC70
  • HSN
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90B1
  • HSPA10
  • HSPA8
  • HSPC1
  • HSPC4
  • HSPCA
  • IAP4
  • ICAM1
  • IFNB2
  • IGEBF
  • IGHE
  • IGHG1
  • IGHG4
  • IGIF
  • IL10
  • IL12A
  • IL12B
  • IL13
  • IL13R
  • IL13RA
  • IL13RA1
  • IL13RA2
  • IL17
  • IL17A
  • IL17F
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • IL23A
  • IL23R
  • IL2RG
  • IL4
  • IL4R
  • IL4RA
  • IL6
  • IL6R
  • IL8
  • IRF4
  • ITGAM
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • JAK3
  • JUNB
  • KIAA0533
  • KIAA0671
  • KIAA1907
  • LAMA5
  • LAZ3
  • LBP
  • LCN2
  • LIF
  • LOG15
  • LOG5
  • LPC1
  • MAOA
  • MCL1
  • MCP1
  • MDA6
  • MDC
  • MDF2
  • MFI7
  • MMP1
  • MMP2
  • MMP3
  • MMP9
  • MOP1
  • MOR1
  • MSK12
  • MUC1
  • MUM1
  • MYC
  • NANOG
  • NC30
  • NDN
  • NGAL
  • NKSF1
  • NKSF2
  • NOS2
  • NOS2A
  • NR1F1
  • NR1F3
  • OCT1
  • OPRD
  • OPRD1
  • OPRM1
  • OSM
  • OTF1
  • P53
  • PASD8
  • PIC1
  • PIK3R1
  • PIM1
  • PKB
  • POMC
  • POU2F1
  • PRAD1
  • PTGS2
  • PUM
  • RAC
  • RHOU
  • RORA
  • RORC
  • RORG
  • RZRA
  • RZRG
  • S1PR1
  • SAA1
  • SCYA11
  • SCYA2
  • SCYA22
  • SDI1
  • SGRF
  • SNL
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SOCS5
  • SOX2
  • SSI1
  • SSI3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT6
  • STMY1
  • TCF8
  • TGFB
  • TGFB1
  • TIMP
  • TIMP1
  • TIP3
  • TNF
  • TNFA
  • TNFBR
  • TNFR2
  • TNFRSF1B
  • TNFSF2
  • TNFSF6
  • TP53
  • TRA1
  • TWIST
  • TWIST1
  • TYK2
  • VCAM1
  • VEGF
  • VEGFA
  • VIM
  • WAF1
  • WRCH1
  • ZBTB27
  • ZEB1
  • ZNF51
Homo sapiens (human)
Noncanonical activation of NOTCH3
  • AD3
  • AD4
  • APH1A
  • APH1B
  • KIAA0253
  • NCSTN
  • NOTCH3
  • NSEP1
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • STM2
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Maturation of nucleoprotein
  • ADPRTL1
  • ARTD15
  • BAL
  • BAL1
  • BAL2
  • C15orf30
  • GSK3A
  • GSK3B
  • KIAA0177
  • KIAA1268
  • N
  • PARP10
  • PARP14
  • PARP16
  • PARP4
  • PARP6
  • PARP8
  • PARP9
  • PARPL
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Defective SLC34A2 causes pulmonary alveolar microlithiasis (PALM)
  • SLC34A2
Homo sapiens (human)
Inhibition of PKR
  • EIF2AK2
  • NS
  • PKR
  • PRKR
Homo sapiens (human)
Amine ligand-binding receptors
  • GPR102
  • GPR143
  • GPR57
  • GPR58
  • OA1
  • PNR
  • TA1
  • TA3
  • TA4
  • TA5
  • TAAR1
  • TAAR2
  • TAAR3
  • TAAR3P
  • TAAR5
  • TAAR6
  • TAAR8
  • TAAR9
  • TAR1
  • TAR3
  • TAR4
  • TAR5
  • TRAR1
  • TRAR3
  • TRAR4
  • TRAR5
Homo sapiens (human)
Activation of BAD and translocation to mitochondria
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2
  • BCL2L8
  • BID
  • CALNA3
  • CNA2
  • CNA3
  • CNB
  • HME1
  • PKB
  • PKBG
  • PPP3CC
  • PPP3R1
  • RAC
  • SFN
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: December 9, 2024