GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 501 - 525 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Manipulation of host energy metabolism
  • ENO1
  • ENO1L1
  • MBPB1
  • MPB1
  • PGK1
  • PGKA
  • esaT6
  • esxA
Homo sapiens (human)
PP2A-mediated dephosphorylation of key metabolic factors
  • BHLHD14
  • F6PK
  • MIO
  • MLXIPL
  • PFKFB1
  • PFRX
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
Mitochondrial protein import
  • AAC1
  • AAC3
  • ACO2
  • AGC1
  • ALR
  • ANT1
  • ANT3
  • ARALAR1
  • ATP5A
  • ATP5A1
  • ATP5AL2
  • ATP5B
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5G1
  • ATP5MC1
  • ATPM
  • ATPMB
  • ATPSB
  • BCS1
  • BCS1L
  • C16orf61
  • C18orf55
  • C19orf1
  • C1orf31
  • C22orf16
  • C2orf9
  • C6.1B
  • C7orf17
  • C9orf105
  • CHCHD10
  • CHCHD2
  • CHCHD3
  • CHCHD4
  • CHCHD5
  • CHCHD7
  • CHCHD8
  • CL640
  • CMC2
  • CMC4
  • COA4
  • COA6
  • COQ2
  • COX17
  • COX19
  • CS
  • CYC1
  • DDP
  • DDP1
  • DDP2
  • DDPL
  • DNAJC19
  • DNAJC20
  • E2IG2
  • EFE2
  • FRDA
  • FXC1
  • FXN
  • G4.5
  • GFER
  • GREPEL1
  • GRP75
  • GRPEL1
  • GRPEL2
  • HERV1
  • HPO
  • HSC20
  • HSCB
  • HSP60
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • HSPD1
  • IDH3G
  • INPP5E
  • KIAA0016
  • KIAA0123
  • KIAA0719
  • KIAA1104
  • LDHD
  • MAGMAS
  • MIA40
  • MIC19
  • MIMT17
  • MIMT44
  • MINOS3
  • MP1
  • MPPA
  • MPPB
  • MTCP1
  • MTCP1NB
  • MTX
  • MTX1
  • MTX2
  • MTXN
  • NDUFB8
  • OBTP
  • OTC
  • PAM16
  • PEREC1
  • PITRM1
  • PMPCA
  • PMPCB
  • PREP
  • SAM50
  • SAMM50
  • SLC25A12
  • SLC25A13
  • SLC25A4
  • SLC25A6
  • TAFAZZIN
  • TAZ
  • TEX4
  • TIM10
  • TIM13B
  • TIM14
  • TIM16
  • TIM17
  • TIM17A
  • TIM17B
  • TIM21
  • TIM22
  • TIM23
  • TIM44
  • TIM50
  • TIM8A
  • TIM8B
  • TIM9
  • TIM9A
  • TIM9B
  • TIMM10
  • TIMM10B
  • TIMM13
  • TIMM13A
  • TIMM13B
  • TIMM14
  • TIMM16
  • TIMM17
  • TIMM17A
  • TIMM17B
  • TIMM21
  • TIMM22
  • TIMM23
  • TIMM44
  • TIMM50
  • TIMM8A
  • TIMM8B
  • TIMM9
  • TIMM9A
  • TIMM9B
  • TOM22
  • TOM40
  • TOM5
  • TOM6
  • TOM7
  • TOM70
  • TOMM07
  • TOMM20
  • TOMM22
  • TOMM40
  • TOMM5
  • TOMM6
  • TOMM7
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • VDAC
  • VDAC1
  • X25
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Activation of C3 and C5
  • BF
  • BFD
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • C5
  • CFB
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
Homo sapiens (human)
Suppression of autophagy
  • DUSP16
  • KIAA1700
  • MKP7
  • RAB7
  • RAB7A
  • eis
  • sapM
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to triglyceride lipolysis in adipose
  • LXRA
  • LXRB
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • PERI
  • PLIN
  • PLIN1
  • RXRA
  • RXRB
  • UNR
Homo sapiens (human)
Regulation of NFE2L2 gene expression
  • BHLHE39
  • CBP
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • MYC
  • NFE2L2
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NOTCH1
  • NRF2
  • P300
  • RELA
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Ficolins bind to repetitive carbohydrate structures on the target cell surface
  • CRARF
  • CRARF1
  • FCN1
  • FCN2
  • FCN3
  • FCNH
  • FCNL
  • FCNM
  • HAKA1
  • MASP1
  • PRSS5
Homo sapiens (human)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FUR
  • FURIN
  • GAS6
  • PACE
  • PCSK3
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
PKA activation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • BCL8B
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • KIAA1544
  • LYST2
  • NBEA
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Nephrin family interactions
  • ACTN1
  • ACTN2
  • ACTN3
  • ACTN4
  • ACVRINP1
  • AIP1
  • CASK
  • CD2AP
  • FYN
  • GRB1
  • GRB4
  • IQGAP1
  • KIAA0051
  • KIAA0705
  • KIAA1867
  • KIRREL
  • KIRREL1
  • KIRREL2
  • KIRREL3
  • LIN2
  • MAGI2
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NEAS
  • NEPH1
  • NEPH2
  • NEPH3
  • NPHN
  • NPHS1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • WASL
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 binding to RAD51
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FRP1
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0259
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • REC1
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • WRN
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer
  • AREG
  • AREGB
  • ARHG
  • BCAP
  • BDNF
  • BTC
  • CD135
  • CD19
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRS2
  • FYN
  • GAB1
  • GAB2
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGF
  • HGL
  • HPTA
  • HRGA
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • IRS1
  • IRS2
  • JTK2
  • KGF
  • KIAA0571
  • KIT
  • KLB
  • KS3
  • LAB7
  • LCK
  • MET
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • NTF3
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • NTRK3
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3AP1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC1
  • RAC2
  • RHEPDGFRA
  • RHOG
  • SCFR
  • SDGF
  • SHPTP2
  • SIS
  • SMDF
  • SRC
  • SRC1
  • STK1
  • STRN
  • TC25
  • TCRIM
  • TGFA
  • TKF
  • TRAT1
  • TRKB
  • TRKC
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
tandutinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
crenolanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
MECP2 regulates transcription of neuronal ligands
  • BDNF
  • CRH
  • DLL1
  • HDAC1
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • SST
Homo sapiens (human)
Defective factor XII causes hereditary angioedema
  • F12
  • F2
  • KLK3
  • KLKB1
Homo sapiens (human)
DDX58/IFIH1-mediated induction of interferon-alpha/beta
  • 9b
  • CEB1
  • CEBP1
  • D11LGP2E
  • DAK
  • DDX58
  • DHX58
  • EFP
  • G1P2
  • HERC5
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • IFIH1
  • IPS1
  • IRF3
  • ISG15
  • KIAA0719
  • KIAA1271
  • LGP2
  • MAVS
  • MDA5
  • N
  • NAK
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TBK1
  • TKFC
  • TOM70
  • TOMM70
  • TOMM70A
  • TRIM25
  • TRIM4
  • UBA7
  • UBCH8
  • UBE1L
  • UBE2
  • UBE2L6
  • UCRP
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Trafficking of myristoylated proteins to the cilium
  • ARFL3
  • ARL3
  • CYS1
  • KIAA2000
  • NPHP3
  • RP2
  • UNC119B
Homo sapiens (human)
TNF signaling
  • ADAM17
  • BAG4
  • CSVP
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • SODD
  • TACE
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
Degradation of the extracellular matrix
  • A2M
  • ACAN
  • AD3
  • ADAM10
  • ADAM15
  • ADAM8
  • ADAMTS1
  • ADAMTS11
  • ADAMTS16
  • ADAMTS18
  • ADAMTS21
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADMP2
  • AGC1
  • BCAN
  • BEHAB
  • BMP1
  • BNSP
  • BSG
  • CALPM
  • CANP3
  • CANPL1
  • CANPL2
  • CANPL3
  • CANPX
  • CAPN1
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPN15
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN4
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CAPNS2
  • CASP3
  • CAST
  • CATL2
  • CD44
  • CDH1
  • CDHE
  • CEGF3
  • CLG
  • CLG1
  • CLG4A
  • CLG4B
  • CPAMD5
  • CPP32
  • CSPG1
  • CSPG7
  • CTSG
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • DCN
  • ELA2
  • ELANE
  • HME
  • HSPG2
  • HTRA
  • HTRA1
  • KIAA0253
  • KIAA0533
  • KIAA0688
  • KIAA0932
  • KIAA1312
  • KIAA1346
  • KIAA1845
  • KIAA1907
  • KIAA2029
  • KLK7
  • KUZ
  • LAMA3
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LHR
  • MADM
  • MDC15
  • MDU2
  • MDU3
  • METH1
  • METH2
  • MIC4
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP18
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • MPSL1
  • MS2
  • MSK16
  • NCL1
  • NCL2
  • NCL3
  • NCL4
  • NCSTN
  • NID
  • NID1
  • OPN
  • OPT
  • OPTC
  • PALBH
  • PCOLC
  • PLG
  • PRSS11
  • PRSS6
  • PS1
  • PSEN1
  • PSNL1
  • PUMP1
  • RASI
  • SCCE
  • SCUBE1
  • SCUBE3
  • SLRR1B
  • SOLH
  • SPP1
  • STMY1
  • STMY2
  • STMY3
  • TLL
  • TLL1
  • TLL2
  • TMPRSS6
  • UVO
Homo sapiens (human)
Signaling by ERBB2 KD Mutants
  • BTC
  • CDC37
  • CDC37A
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • EREG
  • GAB1
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRAS
  • HRAS1
  • HRGA
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • KIAA1225
  • LAP2
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRAS
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SMDF
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CABLES
  • CABLES1
  • CAK
  • CAK1
  • CAP20
  • CAP35
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNH
  • CDC25A
  • CDC25B
  • CDC25HU2
  • CDH1
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CDKN7
  • CIP1
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • KIAA2037
  • KIP1
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAT1
  • MAX
  • MDA6
  • MNAT1
  • MO15
  • MYC
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RB1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL2
  • RNF66
  • SDI1
  • STK1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • WAF1
  • WEE1
  • p27
Homo sapiens (human)
Epigenetic regulation of gene expression by MLL3 and MLL4 complexes
  • AIB3
  • ALR
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BIG3
  • C16orf53
  • DPY30
  • HALR
  • KDM6A
  • KIAA0181
  • KIAA1506
  • KMT2C
  • KMT2D
  • MLL2
  • MLL3
  • MLL4
  • NCOA6
  • PA1
  • PAGR1
  • PAXIP1
  • PAXIP1L
  • PTIP
  • RAP250
  • RBBP5
  • RBQ3
  • TRBP
  • UTX
  • WDR5
Homo sapiens (human)
SDK interactions
  • KIAA1514
  • SDK1
  • SDK2
Homo sapiens (human)

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International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.0

Last updated: December 9, 2024